州政府大厦波士顿实行实权市长制度，市长被授予广泛的行政权力，每四年选举一次。市议会每2年选举一次，有9个席位按照每个选区进行多数投票，另有4个席位进行普选，每个投票者直接对普选候选人进行投票。每个候选人只能投票一次。得票最高的4名候选人当选。议长由议员们选举产生。学校委员会由市长指定。

波士顿现任市长为Martin J. Walsh，2014年1月6日当选为波士顿第54任市长。Martin J. Walsh 拥有波士顿学院（BOSTON COLLEGE） 的政治学学位。

在2016年1月4日的波士顿市议会投票中，出生并成长于芝加哥的30岁华裔吴弭(Michelle Wu)成功当选为波士顿市历史上首位亚裔议长，同时也是首位担任此要职的有色人种女性[4] 。吴弭(Michelle Wu)拥有哈佛大学（HAVARD UNIVERSITY） 的学历。

作为马萨诸塞州首府，波士顿在马萨诸塞州政治生活中扮演重要角色。波士顿还是美国联邦政府在新英格兰的中心，建有约翰·肯尼迪联邦办公大楼和托马斯·奥尼尔联邦大厦。该市还设有美国第一巡回上诉法院、马萨诸塞地区法院，以及波士顿联邦储备银行（联储第一区）总部。该市属于美国众议院马萨诸塞州第8选区和第9选区。

在20世纪末、21世纪初，波士顿的低犯罪率要归功于波士顿警察局与社区、教会的合作，以阻止青少年加入犯罪团伙。因而被誉为“波士顿奇迹”。该市的谋杀案从1990年的152起（谋杀率为十万分之26.5）下降到了1999年的31起（谋杀率为十万分之5.26，其中没有一起是青少年犯罪）。此后几年中，谋杀案件以50%的幅度上下波动：2002年为60起，2003年为39起，2004年为64起，2005年为75起。尽管数字还远不及1990年那样高，但是谋杀率的再度提高已经使许多波士顿人深感不安，开始讨论波士顿警察局是否应该要调整其与犯罪作战的方法。

波士顿的大学是影响该市和整个区域经济的主要因素。他们不仅是主要的雇主，而且将高技术产业吸引到该市及附近地区，包括计算机硬件与软件公司，以及生物工程公司（如千禧年医药）。波士顿每年从国家健康协会得到的资金是所有美国城市中最多的。其他重要产业有金融业（特别是共同基金）和保险业。以波士顿为基地的富达投资（Fidelity）在1980年代帮助普及共同基金，使得波士顿成为美国的顶级金融城市之一。该市还拥有主要银行的地区总部如美洲银行和王者银行（Sovereign），风险资本的中心.波士顿还是一个印刷与出版业中心。教科书出版商霍顿·米夫林出版社的总部设在市内。该市拥有4个主要的会议中心：海恩斯会议中心在后湾，贝赛德博览中心在多尔切斯特，波士顿世界贸易中心和波士顿会议展览中心位于南波士顿的濒水地区。由于它拥有州首府和联邦政府地区中心的地位，法律与政府是该市经济的另一个主要成分。

总部位于该市的大公司有吉列公司（由宝洁公司拥有）和泰瑞达公司（Teradyne），后者是世界顶级的半导体和其他电子试验设备制造商之一。新百伦（New Balance）将总部设在波士顿。其他大公司则将总部设在市区以外，主要是沿着马萨诸塞128号公路。波士顿港是美国东海岸的主要海港之一，也是西半球最古老的仍然活跃的商港和渔港之一。